במסגרת פרוייקט תיירות בינלאומי, המצולם בימים אלה ברחבי הארץ, סייר ראש הממשלה בנימין נתניהו גם בהר מצדה, שם ביקר בבית הכנסת העתיק שבמקום.
מבנה בית כנסת הוקם בימי המלך הורדוס בתקופת בית שני. 

במהלך חפירות ארכיאולוגיות שנערכו במצדה, נמצאו חלקי מגילות גנוזות, פרקים מספר דברים וקטעים מספר יחזקאל וכך אוששה ההשערה שמקום זה אכן שימש כבית כנסת. 

בשנים האחרונות, שוהה באופן קבע בבית הכנסת שעל המצדה סופר סת"ם, הכותב במקום ספרי תורה. דרכו עוברים מידי יום תלמידי בית ספר, בני נוער, חיילים ונערי בר מצווה, אשר זוכים לכתוב אות בספר התורה. 

את רעיון כתיבת הספר, יזם רגע שליח חב"ד באיזור ים המלח, הרב שמעון אלהרר, שאף קיבל את ראש-הממשלה והניח עליו טלית קטן חב"ד, בטרם כתב את האות. 

כאמור, ראש הממשלה בנימין נתניהו, כתב מילה בספר התורה, מתוך הפסוק: "וְכָל-חֲכַם-לֵב, בָּכֶם, יָבֹאוּ וְיַעֲשׂוּ, אֵת כָּל-אֲשֶׁר צִוָּה ה'".